MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 10331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015184	GGC	2	6	169414	169419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168465
3002	NC_015184	CAT	2	6	169440	169445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168465
3003	NC_015184	AATG	2	8	169623	169630	50 %	25 %	25 %	0 %	325168466
3004	NC_015184	AAC	2	6	169721	169726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168466
3005	NC_015184	CGG	2	6	169744	169749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168466
3006	NC_015184	CGG	2	6	169857	169862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168466
3007	NC_015184	ACC	2	6	169902	169907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168466
3008	NC_015184	CTATTC	2	12	169996	170007	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325168466
3009	NC_015184	TTC	2	6	170049	170054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168466
3010	NC_015184	GAT	2	6	170119	170124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168466
3011	NC_015184	GCA	2	6	170136	170141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168466
3012	NC_015184	CGG	2	6	170193	170198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168466
3013	NC_015184	GTG	2	6	170204	170209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168466
3014	NC_015184	GCG	2	6	170258	170263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168466
3015	NC_015184	CGC	2	6	170735	170740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168467
3016	NC_015184	CGA	2	6	170894	170899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168467
3017	NC_015184	CTC	2	6	170909	170914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168467
3018	NC_015184	GAAT	2	8	170924	170931	50 %	25 %	25 %	0 %	325168467
3019	NC_015184	ACGC	2	8	171027	171034	25 %	0 %	25 %	50 %	325168467
3020	NC_015184	GC	3	6	171045	171050	0 %	0 %	50 %	50 %	325168467
3021	NC_015184	GT	3	6	171370	171375	0 %	50 %	50 %	0 %	325168468
3022	NC_015184	CGA	2	6	171419	171424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168468
3023	NC_015184	TCA	2	6	171491	171496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168468
3024	NC_015184	CAG	2	6	171502	171507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168468
3025	NC_015184	GTT	2	6	171509	171514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168468
3026	NC_015184	ACG	2	6	171526	171531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168468
3027	NC_015184	TGC	2	6	171679	171684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168468
3028	NC_015184	GAT	2	6	172071	172076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168469
3029	NC_015184	GT	3	6	172079	172084	0 %	50 %	50 %	0 %	325168469
3030	NC_015184	GCT	2	6	172156	172161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168469
3031	NC_015184	GCG	2	6	172223	172228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168469
3032	NC_015184	TCT	2	6	172267	172272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168469
3033	NC_015184	GCGCT	2	10	172275	172284	0 %	20 %	40 %	40 %	325168469
3034	NC_015184	CGC	2	6	172294	172299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168469
3035	NC_015184	TGT	2	6	172321	172326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168469
3036	NC_015184	TCT	2	6	172360	172365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168469
3037	NC_015184	ATG	2	6	172427	172432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168470
3038	NC_015184	TTGCGC	2	12	172446	172457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168470
3039	NC_015184	GCCGC	2	10	172515	172524	0 %	0 %	40 %	60 %	325168470
3040	NC_015184	GCCTGA	2	12	172574	172585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325168470
3041	NC_015184	CTT	2	6	172586	172591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168470
3042	NC_015184	GCC	3	9	172592	172600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168470
3043	NC_015184	TTG	2	6	172608	172613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168470
3044	NC_015184	TGGCA	2	10	172963	172972	20 %	20 %	40 %	20 %	325168472
3045	NC_015184	CAT	2	6	173031	173036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168472
3046	NC_015184	GTG	2	6	173108	173113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168472
3047	NC_015184	CAT	2	6	173115	173120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168472
3048	NC_015184	GTC	2	6	173143	173148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168472
3049	NC_015184	ACA	2	6	173162	173167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168472
3050	NC_015184	GGT	2	6	173190	173195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168472
3051	NC_015184	GCG	2	6	173216	173221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168472
3052	NC_015184	CTT	2	6	173226	173231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168472
3053	NC_015184	T	6	6	173244	173249	0 %	100 %	0 %	0 %	325168472
3054	NC_015184	GCG	2	6	173354	173359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168472
3055	NC_015184	GCC	2	6	173476	173481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168472
3056	NC_015184	CATT	2	8	173561	173568	25 %	50 %	0 %	25 %	325168472
3057	NC_015184	AG	3	6	173607	173612	50 %	0 %	50 %	0 %	325168472
3058	NC_015184	ATCC	2	8	173744	173751	25 %	25 %	0 %	50 %	325168472
3059	NC_015184	CCGC	2	8	173808	173815	0 %	0 %	25 %	75 %	325168472
3060	NC_015184	TGC	2	6	173839	173844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168472
3061	NC_015184	TCG	2	6	173867	173872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168472
3062	NC_015184	CGG	2	6	173880	173885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168472
3063	NC_015184	TCA	3	9	174017	174025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168472
3064	NC_015184	CGGAC	2	10	174048	174057	20 %	0 %	40 %	40 %	325168472
3065	NC_015184	AAG	2	6	174079	174084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168472
3066	NC_015184	CGT	2	6	174158	174163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168473
3067	NC_015184	TGC	2	6	174206	174211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168473
3068	NC_015184	TGATC	2	10	174224	174233	20 %	40 %	20 %	20 %	325168473
3069	NC_015184	CAGC	2	8	174268	174275	25 %	0 %	25 %	50 %	325168473
3070	NC_015184	GACC	2	8	174311	174318	25 %	0 %	25 %	50 %	325168473
3071	NC_015184	GGA	2	6	174326	174331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168473
3072	NC_015184	CTG	2	6	174384	174389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168473
3073	NC_015184	GC	3	6	174447	174452	0 %	0 %	50 %	50 %	325168473
3074	NC_015184	GTC	2	6	174456	174461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168473
3075	NC_015184	TCG	2	6	174472	174477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168473
3076	NC_015184	ATCT	2	8	174483	174490	25 %	50 %	0 %	25 %	325168473
3077	NC_015184	GCA	2	6	174494	174499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168473
3078	NC_015184	TCA	2	6	174610	174615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168473
3079	NC_015184	T	6	6	174702	174707	0 %	100 %	0 %	0 %	325168473
3080	NC_015184	GAA	2	6	174746	174751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168473
3081	NC_015184	GAT	2	6	174791	174796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168473
3082	NC_015184	GAA	2	6	174827	174832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168473
3083	NC_015184	TGCC	2	8	175144	175151	0 %	25 %	25 %	50 %	325168474
3084	NC_015184	CTT	2	6	175153	175158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168474
3085	NC_015184	ATCG	2	8	175164	175171	25 %	25 %	25 %	25 %	325168474
3086	NC_015184	CCG	2	6	175172	175177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168474
3087	NC_015184	CGA	2	6	175229	175234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168474
3088	NC_015184	AGA	2	6	175297	175302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168474
3089	NC_015184	ACG	2	6	175327	175332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168474
3090	NC_015184	CGA	2	6	175409	175414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168474
3091	NC_015184	TC	4	8	175456	175463	0 %	50 %	0 %	50 %	325168474
3092	NC_015184	GAA	2	6	175932	175937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168475
3093	NC_015184	ATG	2	6	175944	175949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168475
3094	NC_015184	GAT	2	6	176041	176046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168475
3095	NC_015184	TTG	2	6	176786	176791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3096	NC_015184	CAT	2	6	176879	176884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168476
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3098	NC_015184	TGC	2	6	177008	177013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168476
3099	NC_015184	TTG	2	6	177026	177031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3100	NC_015184	T	6	6	177110	177115	0 %	100 %	0 %	0 %	325168476
3101	NC_015184	GCG	2	6	177116	177121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168476
3102	NC_015184	GTT	2	6	177202	177207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3103	NC_015184	GAT	2	6	177215	177220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168476
3104	NC_015184	TCA	2	6	177276	177281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168476
3105	NC_015184	CTG	2	6	177310	177315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168476
3106	NC_015184	GAC	2	6	177337	177342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168476
3107	NC_015184	TGGCA	2	10	177390	177399	20 %	20 %	40 %	20 %	325168476
3108	NC_015184	GTT	2	6	177400	177405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168476
3109	NC_015184	ATC	2	6	177426	177431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168476
3110	NC_015184	AC	3	6	177453	177458	50 %	0 %	0 %	50 %	325168476
3111	NC_015184	ATC	2	6	177515	177520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168477
3112	NC_015184	TCA	2	6	177522	177527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168477
3113	NC_015184	TCG	2	6	177537	177542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168477
3114	NC_015184	GGA	2	6	177569	177574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168477
3115	NC_015184	TGGC	2	8	177609	177616	0 %	25 %	50 %	25 %	325168477
3116	NC_015184	TGA	2	6	177647	177652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168477
3117	NC_015184	CTT	2	6	177708	177713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168477
3118	NC_015184	GGA	2	6	177788	177793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168477
3119	NC_015184	CGCTGT	2	12	177836	177847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168477
3120	NC_015184	CAT	2	6	177870	177875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168477
3121	NC_015184	ATG	2	6	177904	177909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168477
3122	NC_015184	TGGG	2	8	177945	177952	0 %	25 %	75 %	0 %	325168477
3123	NC_015184	CAA	2	6	177967	177972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168477
3124	NC_015184	ACG	2	6	178008	178013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168477
3125	NC_015184	TGG	2	6	178015	178020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168477
3126	NC_015184	CGG	2	6	178202	178207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168478
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3129	NC_015184	ATC	2	6	178320	178325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168478
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3132	NC_015184	AAAG	2	8	178447	178454	75 %	0 %	25 %	0 %	325168478
3133	NC_015184	CCGC	2	8	178526	178533	0 %	0 %	25 %	75 %	325168478
3134	NC_015184	ACC	2	6	178553	178558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168478
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3137	NC_015184	GGC	2	6	178649	178654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168478
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3139	NC_015184	CTT	2	6	179039	179044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168479
3140	NC_015184	TCT	2	6	179075	179080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168479
3141	NC_015184	GCA	2	6	179157	179162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168479
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3143	NC_015184	TC	3	6	179381	179386	0 %	50 %	0 %	50 %	325168479
3144	NC_015184	TGA	2	6	179413	179418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168479
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3151	NC_015184	ACGA	2	8	180383	180390	50 %	0 %	25 %	25 %	325168482
3152	NC_015184	ACA	2	6	180393	180398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168482
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3161	NC_015184	ACG	2	6	180762	180767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168483
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3225	NC_015184	CTGC	2	8	184593	184600	0 %	25 %	25 %	50 %	325168486
3226	NC_015184	GAG	2	6	184604	184609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168486
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3230	NC_015184	CGTCT	2	10	184762	184771	0 %	40 %	20 %	40 %	325168486
3231	NC_015184	TGC	2	6	184775	184780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168486
3232	NC_015184	CTT	2	6	184797	184802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168486
3233	NC_015184	GCG	2	6	184811	184816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168486
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3235	NC_015184	GTC	2	6	185070	185075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168487
3236	NC_015184	TCA	2	6	185091	185096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168487
3237	NC_015184	GGC	2	6	185198	185203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168487
3238	NC_015184	CGAA	2	8	185233	185240	50 %	0 %	25 %	25 %	325168487
3239	NC_015184	TCG	2	6	185253	185258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168487
3240	NC_015184	GCC	2	6	185280	185285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168487
3241	NC_015184	TGC	2	6	185394	185399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168487
3242	NC_015184	CGC	2	6	185408	185413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168487
3243	NC_015184	TTC	2	6	185490	185495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168487
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3245	NC_015184	CGGG	2	8	185813	185820	0 %	0 %	75 %	25 %	325168488
3246	NC_015184	CAG	2	6	185821	185826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168488
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3248	NC_015184	TGCA	2	8	185938	185945	25 %	25 %	25 %	25 %	325168488
3249	NC_015184	TCG	2	6	185989	185994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168488
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3260	NC_015184	GAAG	2	8	186649	186656	50 %	0 %	50 %	0 %	325168489
3261	NC_015184	CGA	2	6	186700	186705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168489
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3263	NC_015184	TCG	2	6	186777	186782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168489
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3269	NC_015184	CGA	2	6	187093	187098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168489
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3272	NC_015184	GC	3	6	187273	187278	0 %	0 %	50 %	50 %	325168489
3273	NC_015184	GCA	2	6	187365	187370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168489
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3277	NC_015184	GAC	2	6	187517	187522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168489
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3341	NC_015184	GC	3	6	192159	192164	0 %	0 %	50 %	50 %	325168496
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3345	NC_015184	ACC	2	6	192295	192300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168496
3346	NC_015184	GCCAT	2	10	192367	192376	20 %	20 %	20 %	40 %	325168496
3347	NC_015184	GC	3	6	192479	192484	0 %	0 %	50 %	50 %	325168497
3348	NC_015184	GGA	2	6	192566	192571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168497
3349	NC_015184	ACC	2	6	192576	192581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168497
3350	NC_015184	CGA	2	6	192653	192658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168497
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3352	NC_015184	ACG	2	6	192793	192798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168498
3353	NC_015184	CCG	2	6	192902	192907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168498
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3355	NC_015184	CGA	3	9	192925	192933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168498
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3357	NC_015184	CG	3	6	193010	193015	0 %	0 %	50 %	50 %	325168498
3358	NC_015184	TGT	3	9	193072	193080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168498
3359	NC_015184	GAC	2	6	193105	193110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168498
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3361	NC_015184	GGC	2	6	193142	193147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168498
3362	NC_015184	GGC	2	6	193161	193166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168498
3363	NC_015184	C	6	6	193257	193262	0 %	0 %	0 %	100 %	325168498
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3457	NC_015184	TGC	2	6	198310	198315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168504
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3469	NC_015184	TC	3	6	198842	198847	0 %	50 %	0 %	50 %	325168504
3470	NC_015184	G	6	6	198854	198859	0 %	0 %	100 %	0 %	325168504
3471	NC_015184	TCG	2	6	198877	198882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168504
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3473	NC_015184	A	6	6	198953	198958	100 %	0 %	0 %	0 %	325168504
3474	NC_015184	GCT	2	6	199073	199078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168504
3475	NC_015184	GTC	2	6	199146	199151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168504
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3477	NC_015184	GCTG	2	8	199278	199285	0 %	25 %	50 %	25 %	325168504
3478	NC_015184	GGC	2	6	199310	199315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168504
3479	NC_015184	GAG	2	6	199347	199352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168504
3480	NC_015184	ATC	2	6	199602	199607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168504
3481	NC_015184	TTC	2	6	199638	199643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168504
3482	NC_015184	CATGC	2	10	199650	199659	20 %	20 %	20 %	40 %	325168504
3483	NC_015184	AAG	2	6	199704	199709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168504
3484	NC_015184	CGG	2	6	199760	199765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168504
3485	NC_015184	CGT	2	6	199865	199870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168504
3486	NC_015184	AGA	2	6	199901	199906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168504
3487	NC_015184	GAC	2	6	199931	199936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168504
3488	NC_015184	GGA	2	6	199938	199943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168504
3489	NC_015184	GTC	2	6	199956	199961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168504
3490	NC_015184	ACG	2	6	200023	200028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168504
3491	NC_015184	GC	3	6	200043	200048	0 %	0 %	50 %	50 %	325168504
3492	NC_015184	TCA	2	6	200068	200073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168504
3493	NC_015184	CGG	2	6	200140	200145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168504
3494	NC_015184	CGC	2	6	200158	200163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168504
3495	NC_015184	GC	3	6	200162	200167	0 %	0 %	50 %	50 %	325168504
3496	NC_015184	GAA	2	6	200267	200272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168504
3497	NC_015184	GGC	3	9	200351	200359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168504
3498	NC_015184	CGA	2	6	200587	200592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168505
3499	NC_015184	GTC	2	6	200689	200694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168505
3500	NC_015184	GC	3	6	200719	200724	0 %	0 %	50 %	50 %	325168505

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